Прежде всего это лещ, судак, щука, окунь, плотва, уклейка, густера. В Селигере много снетка и ерша. Реже вылавливаются язь, линь, карась, налим, ряпушка, верховка, пескарь. В единичных экземплярах встречаются сиг, хариус, голавль, жерех, чехонь, карп, красноперка, минога, елец, щиповка, подкаменщик, вьюн. Изредка попадают рыбы, запущенные в озеро: угорь и пелядь. В садках искусственно выращивается форель. В некоторых озерах водится сом. Прежде, как свидетельствуют научные источники, с Волги на Селигер поднималась стерлядь. По значению и численности на первом месте в ихтиофауне валдайских озер, несомненно, находится лещ.
